長岡藩の藩政を主導していた家老の河井継之助（かわいつぎのすけ）は、1868（慶応4）年5月2日、薩長（新政府軍）と会津（旧幕府軍）の調停を提案しようと企図し、慈眼寺（じげんじ）（小千谷市）の官軍陣屋を訪れ、軍監の岩村精一郎（いわむらせいいちろう）（土佐藩）との会談に及びます。しかし、交渉はものの30分で決裂してしまいました。

この「小千谷談判」直後の5月4日、長岡藩は奥羽越列藩同盟に加盟します。2日遅れて北越5藩（新発田藩、村上藩、村松藩、三根山（みねやま）藩、黒川藩）も加盟し、奥羽越列藩同盟が形成されました。ただし、越後国内の藩でも、与板（よいた）藩や高田藩のように、当初から官軍に恭順の意を示していた藩もありました。

長岡城の再陥落後、領民や藩士たちは会津へ落ち延びていきました。長岡藩家老の河井継之助もそのひとりでしたが、その途中、交戦中に負った膝の傷から破傷風（はしょうふう）を併発して亡くなっています。やがて8月中には越後国はほぼ全域が新政府軍によって占領され、北越戊辰戦争は幕を下ろしました。

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