1964（昭和39）年7月1日には全日空による定期便の運航が始まり、フォッカー社製ターボプロップ双発（そうはつ）旅客機である座席数40席のフレンドシップ27型機が1日1往復、1時間40分の飛行時間で山形と東京を結びました。料金は大人片道5800円で、上野駅までの鉄道運賃920円と比べるとかなり高額でした。翌年には山形空港と改称されました。

1969（昭和44）年には東京便が1日2往復に、その3年後には座席数64席の国産ターボプロップ双発旅客機であるYS-11型機が就航するなど、増大する航空需要や機材の大型化に対処するために長期的な空港整備計画が策定されました。とくにジェット機運用に対応するため、1976（昭和51）年、滑走路を横断するように路面に細い溝を切削するグルービング工事が国内で初めて実施されました。制動距離の短縮や雨天時のハイドロプレ－ニング現象による事故防止が目的で、当時、滑走路長がジェット機の発着に必要な最低ラインの1500mしかなかったためとられた対策です。

ジェット機である座席数126席のボーイング737型機が就航後、1979（昭和54）年には大阪や札幌にも路線が開設されます。次第に名古屋・大阪（関空）・福岡・函館などにも就航し、ピーク時の1991（平成3）年には年間搭乗者数が約74万人に到達しました。翌92年の山形新幹線の開業や2008（平成20）年のリーマンショックの影響で搭乗者数は一気に減少しますが、フジドリームエアラインズが名古屋への運航を開始した2014（平成26）年から再び増加に転じ、4年後には30万人台を回復し今日に至っています。

サクランボ畑の広がる東根市に立地する山形空港。大型機が就航できるようにするため、滑走路を現在の2000mから2500mに延長することが検討されています。

高速交通網の空白地帯であった庄内地方では、1970（昭和45）年頃から空港建設の機運が高まります。美田や防風防砂林を守ろうとする反対派と対立しますが、設計変更や説得の甲斐もあって、1991（平成3）年10月に庄内空港が晴れて開港。東京と大阪へ1日1往復が就航しました。過去には成田・関西・新千歳などにも運航されていましたが、2021（令和3）年4月現在、全日空によって羽田便が1日4往復設定されています。

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