この時、北都留郡、東山梨郡、東八代郡などに住んでいた計650戸・約3000名の人々は、生活の復旧が困難であることから、北海道の南部にある羊蹄（ようてい）山の南麓から北東麓にかけての地域に集団移住し、当地で農業に従事しました。

羊蹄山の麓には、「倶知安（くっちゃん）町山梨」や「京極（きょうごく）町甲斐」など、山梨県にちなんだ名称が付けられた地区や建物などが残っています。集団移住した人々は、富士山に似ている羊蹄山を「蝦夷（えぞ）富士」と呼び、心のよりどころとしていたようです。

しかし、苦労して農業を行ったものの、北海道の冷涼な気候に適応できず、多くの移住者は離農しています。

水害の原因としては、産業の発達に伴う山林の荒廃が指摘されています。江戸時代後期になると、笛吹川とその支流が通る盆地東部の峡東地方では、養蚕業が盛んになり、繭を煮るための木材の需要が高まりました。

さらに明治になってからは蒸気機関等の燃料としても木材需要が拡大し、木材の乱伐が進んだ結果、山林の荒廃が進み、森の保水力が著しく低下してしまいました。これが水害を引き起こした原因と考えられています。

歴史を振り返れば、甲斐国では古くから水害に悩まされていました。武田信玄は、釜無川と御勅使川の合流地点に約20年の歳月をかけて「信玄堤」と呼ばれる堤防を築き、川を治める工事を行いました。

また、笛吹川も大雨が降ると支流河川の影響を受け水害が多発する地域だったため、「万力林」と呼ばれる水防林を造り、下流の村々を守ってきました。

近代に入ると1883（明治16）年には、オランダ人技術者・ローウェンホルスト・ムルデルが現地調査を行っています。ムルデルは、1879（明治12）年に水害対策や水運を目的とした河川改修の指導のため政府から招かれて来日し、桂川流域の河岸崩壊や北巨摩郡の大武川の大崩壊の原因を考察しました。

その結果、森林の伐採や、大武川においては石灰の過剰採石、斜面の開削などの諸点が水害多発の原因と判断しています。このムルデルの調査は、その後の富士川直轄改修など、県の治水事業の契機にもなりました。

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