この原の辻遺跡の大きな特徴のひとつが、西側で発見された東アジア最古と考えられる約2000年前の船着場を備えていること。基礎部分には「敷粗朶（しきそだ）」と呼ばれる中国式の工法が用いられ、木の枝や樹脂、石などが敷かれていました。

その建設には、技術者として朝鮮半島系の人々が関わっており、すでにこの頃から日本と大陸の間に密な交流があったことを示します。

日本と大陸との交流は、非常に多彩な出土品の数々からもうかがい知ることができます。その数は、土器などの土製のものだけで711点。ほかに木器や石器、ガラス製、金属製なども合わせると1670点が国の重要文化財に指定されています。

日本製の遺物だけでなく中国古代の貨幣もあり、中国系の商人が訪れ国際的な経済活動を活発に行っていたことがわかります。また、朝鮮半島系の無文土器など100点以上が集落内からまとまって出土したことから、渡来人が九州に移住するための中継地として長期滞在していたのではないかと考えられます。

出土品の年代は弥生前期から古墳時代初期におよび、約600年の長期間にわたり交易都市として栄えていたようです。

これらの状況から、中国の歴史書『三国志』の『魏志倭人伝（ぎしわじんでん）』に登場する一支国（いっきこく）は壱岐を指しており、原の辻がその王都だったという説があります。同書には、一支国について「三千ばかりの家あり。やや田地あり。田を耕せどもなお食するに足らず。また南北に市糴（してき）す」と記されています。“市糴”とは交易を意味しており、自給自足で補えなかった壱岐では、食糧を確保するためにも交易が大きな役割を担っていました。

しかし、朝鮮半島の後ろ盾となる西晋の滅亡と日本国内の政権変動により、交易ルートが壱岐から福岡（九州本土）に移ってしまいます。これにともない原の辻の役割も小さくなり、4世紀中頃に歴史から姿を消すこととなりました。

調査研究機関の「長崎県埋蔵文化財センター」と、展示施設「壱岐市立一支国博物館」が一体になった複合施設。原の辻遺跡をはじめとする壱岐島内の遺跡や古墳から出土した約2000の遺物が常設展示されています。

また、弥生時代の原の辻の人々の暮らしを再現した巨大ジオラマや当時の交易の様子がわかるビューシアター、木造古代船の模型、原の辻遺跡を一望できる展望台なども見どころです。弥生時代の原の辻を再現した巨大ジオラマには、165体の弥生人フィギュアを展示。その中には、実在する壱岐市民をモデルにした、表情豊かなフィギュアも紛れています。

一風変わった外観は、周辺の景観と弥生時代の風景の調和を目指して黒川紀章氏がデザインしたもので、同氏の遺作にもなりました。

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