7月3日、乃楽山に駐屯した大伴吹負は荒田尾赤麻呂（あらたおのあかまろ）の進言で赤麻呂らを飛鳥京の防衛に向かわせます。赤麻呂は飛鳥京の橋の板を壊して楯として街角に立てる奇策を取りました。

翌4日、兵力の劣る吹負軍は南下してきた大友軍と乃楽山で戦ったものの大敗。宇陀方面に逃走しました。一方、大伴吹負を破った大友方の大野果安（おおののはたやす）らは一気呵成に中ツ道を南下。飛鳥京手前の八口に到着し、天香具山から飛鳥京を見て、前日に並べられた楯を伏兵がいると勘違いして引き返すという失態を犯してしまいます。

敗走した大伴吹負は、その後墨坂で置始菟（おきそめのうさぎ）率いる援軍と出会い、西へ戻って金綱井（かなづなのい）に本営を置きました。そして7月7日から8日あたりに紀阿閉麻呂（きのあへまろ）率いる援軍の本隊が到着。大伴吹負はこれを上ツ道、中ツ道、下ツ道の大和三道に分けて配置し、みずからは中ツ道を守りました。続々と南下してくる大友方の大軍を迎え撃つためです。

上ツ道を守る三輪高市麻呂（みわのたけちまろ）と置始菟の軍は箸陵（箸墓）の戦闘に勝利。中ツ道では吹負らが、村屋社に本陣を置く大友方の将軍・犬養五十君（いぬかいのいきみ）らと戦いますが、劣勢を強いられます。しかし箸陵の戦いに勝った置始菟が中ツ道にかけつけたことで、形成は逆転します。

激戦の末、大海人軍が見事に勝利を収めました。以来、大友軍は大和を襲うことはありませんでした。

『日本書紀』によると、壬申の乱のときにはすでに道路網が整備され、戦いの舞台となっていたことが分かります。

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